銀杏各器官含有不同量的水分。根、莖、枝、葉含水量50%左右，果實含水量約80%。銀杏的生命活動是以水為介質的，水分能使樹體各部分保持膨脹和新鮮狀態。所以，水分在銀杏的生命活動中是不可缺少的生態因子。

銀杏的根系比較發達，依靠根壓吸水供給樹體各個部分的需要，銀杏葉片的蒸騰作用，形成蒸騰拉力，這種拉力成為根系吸取水分的主要動力。而如果我們需要測定銀杏葉片中葉落素的含量我們推薦使用葉綠素測定儀、SPAD-502葉綠素含量儀，它是一種手持式葉綠素含量儀，可以直接帶到田間進行及時測定和記錄，相當方便快捷。銀杏根部的吸水量與土壤持水量有關，土壤持水在水分當量至飽合的范圍內土壤持水量越高，吸水越容易。水分經過輸導組織，送到樹體各器官，保持了水分平衡，土壤持水量在水分當量以下時，就會出現蒸騰大于吸收，樹體枝葉萎蔫下垂，氣孔變小，蒸騰減弱，以求水分平衡暫時恢復。所以銀杏樹體的水分是經常處于動態平衡之中， 這是由銀杏的調結機制和諸多環境因子相互作用的結果。銀杏枝繁葉茂，根系發達，從根部吸收的水分通過葉片的蒸騰作用到大氣中，只有2－3%的水分用于合成碳水化合物。

銀杏抗旱能力較強。在年降水量1000毫米左右的地區，成年及古老樹一般都不需灌溉，作為商品經營的果園，在生長發育主要時期仍應適當澆水。根據年周期內的物候現象，如早春干旱，樹液流動，，萌芽開始，就要及時春灌，否則 將出現生理干旱而“抽條”。花期缺水，容易落花，影響傳粉授精，需要在開花前結合追肥澆水。果實迅速發育期，需水量更大，如果供水不足，會降低品質和產量。幼果發育常和枝葉旺盛生長同步，適時灌溉，達到枝繁葉茂，枝條充分成熟，可以提高越冬性。

同時，在雨季要特別注意排水防澇，并要挖好排水溝。